Informatica medica e sistemi bioinformatici distribuiti

Dipartimento

Dipartimento di Bioingegneria

Responsabile

Francesco Pinciroli, Marco Masseroli, Stefano Bonacina

Attività sperimentali

Anatomia Digitale: selezione automatica di strutture anatomiche dalla base di bioimmagini Visible Human Dataset (VHD), caratterizzazione quantitativa di strutture anatomiche e utilizzo nell’interrogazione visuale di banche dati di bioimmagini. Informatica BioMedica: gestione, data mining e analisi statistica di dati da esperimenti a microarrays; estrazione ed efficace utilizzo di informazioni da banche dati genomiche; analisi di informazioni genomiche e profili di espressione genica per l’identificazione di pathway funzionali. Internet per la medicina e la sanità, con particolare attenzione all’accesso e condivisione di dati clinici distribuiti e ai servizi Web al paziente a rischio di urgenza. Obbiettivi sono lo sviluppo e implementazione prototipale di algoritmi e metodologie innovative per applicazioni mirate, quali, l’interrogazione efficiente di banche dati di bioimmagini e genomiche; la gestione e l’analisi di grandi quantità di dati genetici e proteici; la gestione e di accesso remoto a dati biomedici distribuiti; la fornitura via Web di servizi al paziente, al medico, all’azienda ospedaliera, alla sanità.

Attrezzature

Numerose piattaforme eterogenee, dal punto di vista sia hardware che software, server e software web di gestione, tutte connesse in rete tra loro e collegate alla rete internet con una backbone. Ciò permette riprodurre le situazioni reali di diversi ambienti sanitari aventi da elaboratori equipaggiati con vecchi sistemi operativi e di modeste risorse hardware, a sistemi recentissimi dotati di processori di ultima generazione ed elevata memoria RAM e disco. Strumentazione per la produzione e la gestione di materiale biomedico multimediale, tra cui filmati e immagini digitali anche di lastre radiografiche. Scansioni con scanner medico.